Es uno de los pocos murciélagos europeos que caza rozando la superficie del agua con las patas traseras, casi como un pequeño martín pescador nocturno, arrastrándolas por la lámina de agua para arponear insectos e incluso pequeños peces. Vive en colonias que dependen por completo de cuevas y minas con un microclima muy concreto, cálido y húmedo, lo que lo hace extremadamente sensible a cualquier alteración de esos refugios. Comparte cueva a menudo con otras especies de murciélago cavernícola, formando a veces colonias mixtas de miles de individuos que son de los espectáculos de fauna menos conocidos de la cuenca mediterránea.
Murciélago de tamaño pequeño-medio, pelaje pardo grisáceo en el dorso y más claro en el vientre, patas traseras y pies grandes y robustos con pelos rígidos adaptados a la pesca por arrastre, y orejas cortas en comparación con otros Myotis. Se confunde con el vespertilio de Daubenton (Myotis daubentonii), de hábitos de caza sobre el agua similares, del que se distingue por el pie proporcionalmente mayor y por asociarse casi siempre a refugios cavernícolas en vez de árboles o puentes.
Frecuencia de máxima energía entre 40 y 55 kHz. Pulso de tipo FM (frecuencia modulada), con un barrido descendente pronunciado que en la pantalla del detector aparece como un trazo curvo e inclinado, típico del género Myotis. Duración muy corta, de 2 a 4 milisegundos, con intervalo entre pulsos que se acorta mucho al aproximarse a la superficie del agua durante la caza. Es una especie difícil de separar con seguridad de otros Myotis por el sonograma en solitario; conviene apoyar la identificación con el comportamiento de vuelo rasante sobre el agua y, siempre que sea posible, con captura o genética. Bajo las entradas de cueva ocupadas puede acumularse guano fino y granuloso en montones bajo los puntos de percha, junto a manchas de orina en las paredes rocosas cercanas; emerge poco después de la puesta de sol para dirigirse directamente a masas de agua próximas.
Cuevas, minas y otros refugios subterráneos cálidos y húmedos para el descanso diurno, con caza casi siempre sobre cursos de agua lentos, embalses y estanques cercanos. Distribuido por la cuenca mediterránea, desde la península ibérica y el norte de África hasta Oriente Próximo, en altitudes generalmente bajas y medias.
Insectívoro, captura insectos acuáticos y terrestres que sobrevuelan la superficie del agua, arrastrando las patas traseras por la lámina de agua para arponearlos; se ha documentado también la captura ocasional de pequeños peces.
Forma colonias de cría muy numerosas y a menudo mixtas con otras especies cavernícolas, con una fuerte fidelidad al mismo refugio subterráneo año tras año. Es muy sensible a la molestia humana en las cuevas de cría e hibernación, donde puede pasar el invierno en grupos densos.
Sus poblaciones se consideran en declive en buena parte de la cuenca mediterránea por la pérdida y alteración de refugios subterráneos, aunque algunas colonias grandes protegidas en cuevas gestionadas se mantienen relativamente estables.
Alteración y cierre de cuevas y minas usadas como refugio, molestia humana y espeleología no regulada en colonias de cría e hibernación, contaminación y degradación de los cursos de agua donde caza, y pérdida de conectividad entre refugios.
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