Es el topo menos conocido de Norteamérica, restringido a un puñado de localidades en la Sierra de San Pedro Mártir, en Baja California, donde ocupa suelos sueltos y arenosos entre vegetación escasa de montaña. Durante gran parte del siglo XX se consideró una simple subespecie del topo de pata ancha (Scapanus latimanus), hasta que un análisis morfológico posterior lo revalidó como especie propia por sus diferencias de tamaño y coloración.
Topo de tamaño menor que su pariente cercano S. latimanus, con cabeza y cuerpo de 110-114 mm, cola de 21-25 mm y un peso de 30-35 g; los machos son notablemente mayores que las hembras. El dorso es pardo canela con reflejos plateados, y el vientre gris. Se diferencia de S. latimanus, con el que no coincide geográficamente, sobre todo por el tamaño menor.
Como el resto de los topos, señala su presencia por crestas de tierra levantada en superficie y pequeños montículos cónicos de tierra suelta en los puntos de ventilación de galerías más profundas, en el suelo arenoso suelto que prefiere. No deja huellas reconocibles al desplazarse bajo tierra.
Suelo suelto y arenoso con vegetación escasa en la Sierra de San Pedro Mártir, Baja California (México), conocido de un número muy reducido de localidades.
Se alimenta de insectos, lombrices de tierra y otros invertebrados del suelo.
Solitario y fosorial, con hábitos generales similares a los de otros topos del género Scapanus.
Sin evaluación propia por parte de la UICN, que lo trata en algunas fuentes como sinónimo de S. latimanus; la normativa mexicana lo incluye entre las especies con alguna categoría de protección debido a su rango extremadamente restringido.
Su distribución conocida, limitada a unas pocas localidades de una única sierra, lo hace vulnerable a cualquier alteración del hábitat en esa zona.
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